得益于海洋種業(yè)技術(shù)的不斷突破,福建省“海上糧倉(cāng)”高質(zhì)量發(fā)展。圖為福建省福州市連江縣黃岐鎮(zhèn)大建村海域的海上養(yǎng)殖一派繁忙。王旺旺 攝
廈門大學(xué)鮑魚育種團(tuán)隊(duì)科研人員在晉江福大鮑魚水產(chǎn)有限公司育種車間開展科研。(受訪單位供圖)
海水養(yǎng)殖生物育種全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室科研人員在檢測(cè)大黃魚種苗的生長(zhǎng)、健康狀況。福建日?qǐng)?bào)記者 李珂 攝
海水養(yǎng)殖生物育種全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。福建日?qǐng)?bào)記者 李珂 攝
福建省有著超過3300公里的海岸線,海洋是福建的“海上農(nóng)田”。海洋種業(yè),是海上養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展的“芯片”,是保障“海上農(nóng)田”“藍(lán)色糧倉(cāng)”的關(guān)鍵。福建海洋種業(yè)發(fā)展水平如何?如何發(fā)揮科研優(yōu)勢(shì),突破海洋水產(chǎn)育種技術(shù)?
作為目前我國(guó)水產(chǎn)育種領(lǐng)域獲批的兩個(gè)全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室之一,也是全國(guó)首批、福建首個(gè)全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室——海水養(yǎng)殖生物育種全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,聚焦優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、抗病、抗逆的魚、蝦、貝、藻等海水養(yǎng)殖新品種創(chuàng)制及轉(zhuǎn)化應(yīng)用,攻關(guān)突破種業(yè)“卡脖子”關(guān)鍵技術(shù),服務(wù)國(guó)家藍(lán)色食品產(chǎn)出與海洋種業(yè)發(fā)展重大戰(zhàn)略需求。
該實(shí)驗(yàn)室在“大黃魚育種國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室”的基礎(chǔ)上進(jìn)行優(yōu)化重組,依托寧德市富發(fā)水產(chǎn)有限公司、廈門大學(xué)、集美大學(xué)、福建農(nóng)林大學(xué)共同組建,于2022年11月經(jīng)科技部批準(zhǔn)建設(shè),重組后聚焦海水養(yǎng)殖業(yè)重大良種需求,匯集福建省海水養(yǎng)殖生物方向的平臺(tái)、技術(shù)與人才等,使產(chǎn)學(xué)研結(jié)合更加緊密,為海水養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展提供強(qiáng)大的技術(shù)支撐。
近日,記者走訪海水養(yǎng)殖生物育種全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,窺探“藍(lán)色糧倉(cāng)”里的種業(yè)創(chuàng)新力量。
破解“基因密碼”
創(chuàng)“中國(guó)芯”
早上8時(shí),在位于福建省寧德市的海水養(yǎng)殖生物育種全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,科研人員柯巧珍和同事們正在對(duì)大黃魚進(jìn)行組織采樣,開展基因測(cè)試,檢測(cè)大黃魚種苗的生長(zhǎng)、健康狀況。
“在這里,我們運(yùn)用芯片和大數(shù)據(jù)技術(shù)來檢測(cè)大黃魚的基因,快速選出優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)的大黃魚親本,用于大黃魚育種?!笨虑烧湔f。
作為我國(guó)特有的地方性海水魚類,大黃魚曾居我國(guó)海洋“四大漁業(yè)”之首,但因過度捕撈,到20世紀(jì)70年代,大黃魚資源瀕臨枯竭。
30多年來,通過科技支撐、品牌優(yōu)先、提質(zhì)養(yǎng)殖、做深加工等舉措,寧德大黃魚從瀕臨滅絕的物種發(fā)展壯大為年產(chǎn)值上百億元的富民產(chǎn)業(yè)。
然而,多年來,“白點(diǎn)病”一直是大黃魚養(yǎng)殖戶的“心病”,每年秋末、春初大黃魚病多發(fā),感染后的魚類死亡率少則三成,多則九成,損失慘重。
如何破題?從2017年起,海水養(yǎng)殖生物育種全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任、廈門大學(xué)海洋與地球?qū)W院副院長(zhǎng)徐鵬教授帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì),與寧德企業(yè)合作,勇闖“無人區(qū)”,將抗刺激隱核蟲大黃魚選育作為第一個(gè)選育方向。
魚類的抗病育種,尤其是針對(duì)寄生蟲病的抗病育種工作,在世界范圍內(nèi)都是極具挑戰(zhàn)性,困難重重。
“大黃魚的‘白點(diǎn)病’,是由海水中的刺激隱核蟲引起的寄生蟲疾病?!毙禊i說,首先,團(tuán)隊(duì)收集并孵化出“白點(diǎn)病”的感染源——刺激隱核蟲的幼蟲。
在寧德大黃魚育種基地,徐鵬團(tuán)隊(duì)先用這些寄生蟲對(duì)健康的大黃魚進(jìn)行人工感染,結(jié)果顯示,大黃魚養(yǎng)殖群體內(nèi)部存在對(duì)刺激隱核蟲感染抗性的個(gè)體差異和多態(tài)性。它們雖被感染,但仍有不少個(gè)體可以存活,而這些存活的正是團(tuán)隊(duì)要尋找的“優(yōu)等生”。
但如何在不感染魚群的情況下,優(yōu)中選優(yōu),培育“抗病的大黃魚”?
緊接著,徐鵬團(tuán)隊(duì)與寧德市富發(fā)水產(chǎn)有限公司開展產(chǎn)學(xué)合作,依托大黃魚育種國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室平臺(tái),聯(lián)合開發(fā)出首個(gè)大黃魚基因組育種芯片——“寧芯”系列高通量SNP芯片。
這小小的芯片由二氧化硅制作而成,上面分布著幾十萬個(gè)DNA探針,將從魚鰭中提取的DNA放在芯片上檢測(cè),就能快速準(zhǔn)確地獲取大黃魚幾十萬個(gè)基因位點(diǎn)的信息?!斑@些基因位點(diǎn)就是抗性大黃魚的‘遺傳密碼’?!毙禊i說。
芯片的開發(fā),幫助團(tuán)隊(duì)進(jìn)行大黃魚海量基因型的準(zhǔn)確鑒定,大大提高了抗“白點(diǎn)病”新品系選育工作的準(zhǔn)確性和效率。正是借助超級(jí)計(jì)算機(jī)和育種算法,大黃魚“優(yōu)等生”的秘密得以破解。
這也是目前國(guó)際上首次針對(duì)嚴(yán)重危害海水養(yǎng)殖魚類的刺激隱核蟲病開展技術(shù)攻關(guān)并取得顯著進(jìn)展的抗蟲育種工作,通過累代選育,最終獲得可以推廣的養(yǎng)殖大黃魚抗病新品種。
2021年年底,團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步開發(fā)了具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的“中國(guó)芯”——“寧芯3號(hào)”液相育種芯片并投入應(yīng)用,進(jìn)一步降低基因分型成本、提高基因分型效率,為大黃魚種質(zhì)資源保護(hù)、種業(yè)科技創(chuàng)新和種業(yè)振興再添“利器”。
全基因組選擇是目前育種領(lǐng)域的前沿技術(shù),要進(jìn)行全基因組選擇,就要掌握高通量分型技術(shù)。隨著研發(fā)的迭代,“寧芯”系列芯片分型通量不斷加大、成本不斷降低、速度不斷加快、準(zhǔn)確率不斷提高。
近日,實(shí)驗(yàn)室又有令人振奮的成果——大黃魚“寧芯4號(hào)”研發(fā)成功。徐鵬透露,該芯片在基因分型準(zhǔn)確性與“寧芯3號(hào)”一致的基礎(chǔ)上,基因分型成本降低一半;基于基因型填充技術(shù),可以高效精準(zhǔn)獲取5.5萬多個(gè)基因座位的基因型數(shù)據(jù),為高效開展大黃魚基因組選擇育種應(yīng)用提供技術(shù)支撐。
8年來,“寧芯”系列芯片技術(shù)已推廣至全國(guó)9家科研單位和育種企業(yè),已完成18570份大黃魚樣本檢測(cè),新增產(chǎn)值269.265萬元。該系列芯片的成功研發(fā),推動(dòng)大黃魚基因組育種的全面“芯片化”,從而大大推進(jìn)大黃魚良種選育的高速發(fā)展。
攥緊種業(yè)“中國(guó)芯”,筑牢“海上糧倉(cāng)”。海水養(yǎng)殖生物育種全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室不僅擁有頂尖的大黃魚芯片技術(shù),還著力開發(fā)“鮑芯”系列育種芯片。
皺紋盤鮑是我國(guó)最主要的鮑魚養(yǎng)殖品種,而福建夏季的持續(xù)高溫常常造成鮑魚的大量死亡。與國(guó)外的鮑魚產(chǎn)品相比,我國(guó)的大規(guī)格鮑魚產(chǎn)品稀少,大鮑需要依賴國(guó)外進(jìn)口,而解決上述問題最有效的手段就是選育優(yōu)良性狀的鮑品種。
基于皺紋盤鮑全基因組序列及數(shù)十萬份重測(cè)序數(shù)據(jù),廈門大學(xué)海洋與地球?qū)W院柯才煥團(tuán)隊(duì)用液相探針雜交靶向基因分型技術(shù),開發(fā)了皺紋盤鮑40K液相育種芯片“鮑芯1號(hào)”,該芯片能夠?qū)Σ煌U魚群體的遺傳變異進(jìn)行有效區(qū)分,提高鮑種質(zhì)育種的效率。
把論文“寫入”海區(qū)
讓種業(yè)企業(yè)強(qiáng)起來
中國(guó)是世界第一養(yǎng)鮑大國(guó),我國(guó)鮑魚產(chǎn)量占全球的90%,產(chǎn)業(yè)鏈年產(chǎn)值約500億元,鮑產(chǎn)業(yè)以1%的貝類產(chǎn)量創(chuàng)造了15%的貝類產(chǎn)值,是我國(guó)重要的海水養(yǎng)殖貝類。
在靠海吃海的晉江,鮑魚是這里的農(nóng)業(yè)優(yōu)勢(shì)產(chǎn)品,因此,培育優(yōu)質(zhì)的種鮑至關(guān)重要。
在福建省泉州市晉江市金井鎮(zhèn)南江村海岸邊的晉江福大鮑魚水產(chǎn)有限公司(以下簡(jiǎn)稱“福大鮑魚公司”)育種車間,廈門大學(xué)高級(jí)工程師駱軒正在和公司技術(shù)員觀察鮑魚種苗的生長(zhǎng)狀況。秋季10月,鮑魚就將進(jìn)入繁殖季,科研人員挑選了最大體重能達(dá)到1千克的綠鮑,準(zhǔn)備跟皺紋盤鮑進(jìn)行雜交育種,為漁民培育足夠的鮑魚苗。
“鮑魚育種,首先是選出種鮑,但種鮑數(shù)量非常少,需要通過對(duì)它進(jìn)行擴(kuò)繁,等到性腺成熟后就變成親鮑,這些親鮑就可以受精繁殖出小苗用于出售了?!瘪樮幷f。
2007年,福大鮑魚公司和廈門大學(xué)開展產(chǎn)學(xué)研合作,引進(jìn)了國(guó)內(nèi)頂尖鮑魚育種團(tuán)隊(duì),當(dāng)時(shí),還在讀博士的駱軒便是其中一員。“雙方合作從那時(shí)起,至今沒有中斷過。”駱軒說。
福大鮑魚公司成立于2006年。2013年,受國(guó)內(nèi)外海鮮消費(fèi)市場(chǎng)低迷的影響,公司一度出現(xiàn)經(jīng)營(yíng)困難,陷入養(yǎng)得越多虧得越多的窘境。
“為什么我們不轉(zhuǎn)變思路,做鮑魚產(chǎn)業(yè)金字塔的頂端,開展商業(yè)化鮑魚育種?而且我們本身已經(jīng)有這樣的科研基礎(chǔ)支持?!瘪樮幍囊痪湓?,“點(diǎn)醒”了企業(yè)方。從此,福大鮑魚公司開始了轉(zhuǎn)型升級(jí)之路。
鮑魚是福建水產(chǎn)千億產(chǎn)業(yè)的龍頭,年產(chǎn)值200多億元,占全國(guó)鮑魚產(chǎn)量的80%。種苗作為養(yǎng)殖業(yè)利潤(rùn)的金字塔頂端,成為晉江企業(yè)攻堅(jiān)的目標(biāo)。
“這一片原來都是養(yǎng)殖車間,都是養(yǎng)成品鮑,后來我們改成養(yǎng)種鮑、養(yǎng)親鮑,這個(gè)單產(chǎn)價(jià)值就提上來了?!瘪樮幓貞浀?。
在廈門大學(xué)科研團(tuán)隊(duì)幫助下,福大鮑魚公司開展了大規(guī)模的設(shè)備升級(jí)改造工作。與此同時(shí),鮑魚種業(yè)工程、智能型鮑魚循環(huán)水養(yǎng)殖示范基地建設(shè)也緊鑼密鼓地展開……
在生物界,鮑魚也存在不能適應(yīng)自然生態(tài)環(huán)境而減產(chǎn)或種鮑近親繁殖嚴(yán)重導(dǎo)致性狀退化的情況,如何馴化、培育出更具生態(tài)競(jìng)爭(zhēng)力和商業(yè)價(jià)值的鮑魚新品種?這成為擺在廈大鮑魚育種團(tuán)隊(duì)面前的大課題。
當(dāng)時(shí),西盤鮑成為團(tuán)隊(duì)的主要研究對(duì)象。這是一個(gè)從日本長(zhǎng)崎引進(jìn)的母鮑和晉江本地的父系皺紋盤鮑雜交獲得的新品種。
駱軒說,一個(gè)新品種要經(jīng)過4代以上的培育,每一代需要2至3年。若是兩年的話,就需要8年時(shí)間,加上2至3年的中試示范推廣,才能進(jìn)行小規(guī)模的推廣應(yīng)用,最終才有機(jī)會(huì)去申報(bào)國(guó)家級(jí)的新品種。
2014年,新培育的國(guó)家級(jí)鮑魚新品種西盤鮑推向市場(chǎng),取得不錯(cuò)的效益。接著,團(tuán)隊(duì)培育出的綠盤鮑更令人刮目相看,其養(yǎng)殖單產(chǎn)比普通品種提高2倍以上,產(chǎn)值提高3倍以上,得到廣大養(yǎng)殖戶的認(rèn)可。
眼下,通過開展西盤鮑、綠盤鮑等國(guó)審水產(chǎn)新品種的示范應(yīng)用及皺紋盤鮑“福海1號(hào)”新品系的研發(fā),企業(yè)在鮑魚苗種產(chǎn)品高中低三個(gè)層次的產(chǎn)品體系實(shí)現(xiàn)了全覆蓋,形成年產(chǎn)新品種鮑苗1000多萬粒、種鮑50萬粒以上的規(guī)模,確保終端市場(chǎng)穩(wěn)定獲得綠色、安全、健康的鮑魚產(chǎn)品。
隨著合作的深入,福大鮑魚公司從幾口育種池起步,到擁有了3500平方米的育種車間,每年可繁育形成200多個(gè)鮑魚家系、10多個(gè)鮑魚種質(zhì)資源群體,牢牢確立了行業(yè)領(lǐng)先地位。
“通過開展產(chǎn)學(xué)合作,我們先后實(shí)施多個(gè)省部級(jí)重大科研項(xiàng)目?!瘪樮幗榻B,依托企業(yè),團(tuán)隊(duì)建成國(guó)際一流、國(guó)內(nèi)最大的鮑魚育種基地——福建省鮑魚遺傳育種中心。該中心保存有鮑魚種類7個(gè)、國(guó)家級(jí)鮑魚新品種3個(gè)、選育品系33個(gè)、家系320余個(gè),現(xiàn)已成為我國(guó)保有鮑魚遺傳材料最為齊全、制種能力最強(qiáng)的種質(zhì)資源庫(kù)。
今年1月,農(nóng)業(yè)農(nóng)村部公布新一輪國(guó)家級(jí)水產(chǎn)良種場(chǎng)批準(zhǔn)名單,福大鮑魚公司獲批為國(guó)家級(jí)皺紋盤鮑良種場(chǎng),成為福建省首家正式入編“國(guó)家隊(duì)”的水產(chǎn)良種企業(yè)。
科研團(tuán)隊(duì)與企業(yè)的強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)手,助力海洋產(chǎn)業(yè)欣欣向榮。目前,晉江已形成產(chǎn)值超10億元的鮑魚全產(chǎn)業(yè)鏈新業(yè)態(tài),建成2個(gè)國(guó)家級(jí)“一村一品”鮑魚養(yǎng)殖示范村,“金井鮑魚”入選農(nóng)業(yè)農(nóng)村部全國(guó)名特優(yōu)新農(nóng)產(chǎn)品,促進(jìn)了當(dāng)?shù)貪O業(yè)轉(zhuǎn)型升級(jí)。
福大鮑魚公司的“試驗(yàn)田”,試出了一條水產(chǎn)種業(yè)育、繁、推一體化的產(chǎn)業(yè)發(fā)展之路,也為水產(chǎn)品育種打了樣。
“做育種工作要‘頂天’,就是要做最前沿的研究,解決行業(yè)里最棘手的難題;又要‘立地’,就是要與產(chǎn)業(yè)對(duì)接,深入一線,用技術(shù)服務(wù)社會(huì)?!瘪樮幈硎尽?/p>
聯(lián)合育種
激發(fā)“芯”動(dòng)力
量身長(zhǎng)、測(cè)體重、做心率檢查、參加游泳測(cè)試……在海水養(yǎng)殖生物育種全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,科研團(tuán)隊(duì)探索的腳步并未停下,他們?yōu)榇簏S魚設(shè)計(jì)了一個(gè)個(gè)“賽程”,通過人工智能反映大黃魚的抗性,借“跑步機(jī)”選育“運(yùn)動(dòng)健將”級(jí)別的大黃魚……
育種的道路上,沒有最好,只有更好。
心率是評(píng)估魚類生理狀態(tài)的重要指標(biāo),而目前主流的魚類心率測(cè)量方法常需要侵入魚體或需要復(fù)雜精細(xì)的操作。實(shí)驗(yàn)室研究團(tuán)隊(duì)在國(guó)際上首次將反射型PPG(穿戴式手環(huán)手表的心率測(cè)量方法)和rPPG(一種通過攝像頭測(cè)量心率的方法)引入魚類心率測(cè)量領(lǐng)域。
近日,相關(guān)研究成果“利用光電容積脈搏波描記法可進(jìn)行非侵入式魚類心率測(cè)量”,在國(guó)際實(shí)驗(yàn)生物學(xué)知名期刊Journal of Experimental Biology上成功發(fā)表。
“這是一個(gè)集成了光發(fā)射器和光接收器的光電傳感器?!笨蒲腥藛T說著,將一個(gè)指甲蓋大小的傳感器放在大黃魚身上,通過傳感器能檢測(cè)到大黃魚活體組織中血液容積的變化,從而得到心率數(shù)據(jù)。
另一種方法,則是通過攝像頭來捕捉大黃魚在心動(dòng)周期引發(fā)的皮膚顏色細(xì)微變化而判別,從而為研究魚類在自由狀態(tài)下的心率測(cè)量提供了基礎(chǔ)?!斑@種方法常用于人類心率和脈搏的遠(yuǎn)程監(jiān)測(cè),在魚類的研究中未曾被報(bào)道過。”科研人員說。
傳統(tǒng)測(cè)量方法可能會(huì)對(duì)魚造成傷害或操作復(fù)雜,而這些非侵入式方法既不會(huì)傷害魚,操作簡(jiǎn)便,能更高效、準(zhǔn)確地測(cè)量大黃魚心率,還能應(yīng)用在大黃魚的健壯性育種等方面,為大黃魚養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的發(fā)展提供了重要的技術(shù)支持和新的研究思路。
非侵入式的大規(guī)模測(cè)評(píng)大黃魚系統(tǒng),只是該實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的表型測(cè)評(píng)精準(zhǔn)評(píng)價(jià)技術(shù)裝置之一。此外,該實(shí)驗(yàn)室還研制了鮑心率性狀的精準(zhǔn)化測(cè)評(píng)系統(tǒng)等多套裝置。
目前,該實(shí)驗(yàn)室已構(gòu)建大黃魚、鮑魚、對(duì)蝦、紫菜種質(zhì)資源庫(kù),創(chuàng)立了一系列種質(zhì)資源遺傳評(píng)價(jià)技術(shù)體系,并且成功培育了一系列水產(chǎn)新品種。
聯(lián)合育種作為一種高效且創(chuàng)新的育種模式,正逐漸成為行業(yè)關(guān)注的焦點(diǎn)。該實(shí)驗(yàn)室與中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院東海水產(chǎn)研究所、寧波市海洋與漁業(yè)研究院、廣東省農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣中心、廣東省鰉鯨海洋生物科技有限公司開啟了聯(lián)合育種。
“通過聯(lián)合育種,我們確定大黃魚的群體,進(jìn)行后續(xù)研究工作的開展,以實(shí)現(xiàn)大黃魚遺傳資源的收集、評(píng)估與共享?!笨虑烧湔f,大黃魚形態(tài)上的差異很難通過人肉眼進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化判斷,而基于“寧芯3號(hào)”液相芯片基因分型平臺(tái),對(duì)不同海域的大黃魚基因進(jìn)行檢測(cè)和分析,實(shí)現(xiàn)對(duì)大黃魚各地理群體進(jìn)行精準(zhǔn)劃分,也可以對(duì)經(jīng)過幾代選育形成的新品系進(jìn)行精準(zhǔn)品系鑒定,有助于提高育種效率,培育具有良好性狀的新品種。
為農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化安上“中國(guó)芯”,把論文“種”進(jìn)大海,種業(yè)創(chuàng)新是推動(dòng)農(nóng)業(yè)發(fā)展的核心動(dòng)力。湛藍(lán)大海里的魚、蝦、貝、藻產(chǎn)量產(chǎn)值大幅升級(jí)、多元發(fā)展的背后,是育種技術(shù)的不斷突破。
責(zé)任編輯:黃伉玎 劉子超